在國內外共12位專業評審數天密集的看片、會議及長時間討論之後,得獎影片名單終於出爐。「國際長片競賽」、「國際短片競賽」各有16部長短片入選,角逐長片首獎1名(獎金美金1萬元)、優等獎2名(獎金美金6000元);短片首獎1名(獎金美金5000元)、優等獎2名(獎金美金2500元)。「國際長片競賽」首獎由《奶奶的老屋》奪得。
2006紀錄片雙年展特別引介在世界各地巡迴放映卻備受爭議的波蘭導演亞特•祖米弗斯基的專題【跨界與探索】,這位來自波蘭同時也是視覺藝術家的紀錄片導演,往往在作品當中以「半強迫性質」的方式質問及挑戰被拍攝的對象,以作為他探索真實的方式,並將這種過程完整且殘酷的呈現在觀眾面前,也同時拋出了人是否對於自我意識具有主導性,以及究竟紀錄片的界線何在等問題。
如何從琳瑯滿目的片單中挑選出最適合自己的片子呢?策展人游惠貞及影評人將親自傳授『選片撇步』
台灣首次由國家級美術館承辦的紀錄片雙年展,也首次邀請到具有豐富的紀錄片館藏的「紐約現代美術館(MOMA)」共襄盛舉,由發展90年的紀錄片電影史當中,精選具有指標意義及代表性的經典紀錄片,呈現出各個世代紀錄片發展對趨勢和潮流。